Né en 1970 à Weisswasser, il étudie les arts graphiques dans une école d’art berlinoise. Depuis 1999, il travaille au sein du collectif d’artistes « Monogatari » dont il est l’un des fondateurs. Ses reportages en bande dessinée sur des villes telles que Berlin, Bâle, Lucerne, Marseille et Jérusalem figurent au sommaire de plusieurs revues et ouvrages collectifs.
Repéré par Thierry Groensteen, il publie deux livres aux Éditions de l’An 2 : Leviathan (2003 ; nouvelle édition 2005) et La Cité de Dieu (2006). Alpha... directions paraît en 2009, simultanément chez Actes Sud (édition française) et chez Carlsen (édition allemande), inaugurant une tétralogie sur l’histoire du monde : Le Grand Récit.
Jens Harder est également l’auteur de Gilgamesh et de Cités. Lieux vides, rues passantes, ouvrage qui réunit tous ses reportages dessinés.
Il vit à Berlin. Son travail a été exposé dans de très nombreux musées.